Anton Nekrutenko

Anton Nekrutenko est né à Kiev, en Ukraine (ex-URSS). Il a obtenu une maîtrise en biochimie et biologie moléculaire de l’université d’État de Kiev. Il a ensuite déménagé aux États-Unis pour terminer son doctorat à la Texas Tech University.

Le Dr Nekrutenko a effectué un travail postdoctoral à l'Université de Chicago où il s'est tourné vers la génomique informatique. Après avoir déménagé à l'Université d'État de Pennsylvanie en tant que professeur adjoint, lui et ses collaborateurs ont développé la plate-forme Galaxy pour l'analyse des données biologiques. Il est aujourd'hui professeur de biochimie et de biologie moléculaire et membre fondateur degalaxyproject.org.

Le projet Galaxy, une plate-forme Web de premier plan pour l'analyse des données biologiques, a été lancé dans mon laboratoire en 2005. Depuis lors, il est devenu une communauté mondiale dynamique qui rassemble des chercheurs en biologie, des développeurs de logiciels et des éducateurs sur les cinq continents.

Malgré ce succès remarquable, le système actuel accuse un retard dans son applicabilité aux problèmes de recherche virale et bactérienne. Il s'agit d'un défaut critique, car la génomique microbienne est extrêmement importante pour surmonter certains des problèmes les plus critiques de la recherche biomédicale moderne, tels que la résistance aux antibiotiques, l'émergence de nouveaux agents pathogènes ou les pandémies mondiales telles que celle causée par le SARS-CoV-2.

L'objectif de cette proposition est de remédier directement à ces lacunes en unissant nos forces avec les chercheurs activement impliqués dans la recherche microbiologique et en renforçant les liens entre les côtés européen et nord-américain du projet Galaxy. Cette bourse avec MAK’IT, en collaboration avec le Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE), le principal spécialiste de la génomique évolutive microbienne, m’aidera à comprendre pleinement les défis immédiats auxquels sont confrontés les microbiologistes expérimentaux.