Kateryna Makova

Originaire d'Ukraine, Kateryna Makova a obtenu son doctorat à la Texas Tech University, où elle a étudié les conséquences génétiques de l'accident de la centrale nucléaire de Tchernobyl. Elle a ensuite terminé ses études postdoctorales à l'Université de Chicago, où elle a étudié les différences dans les taux de mutation entre les hommes et les femmes, entre autres sujets.

Elle est professeure au département de biologie de l'Université d'État de Pennsylvanie depuis 2003. Son laboratoire mène des recherches en génomique évolutive et médicale. Les sujets d'intérêt actuels comprennent l'évolution des chromosomes sexuels, l'évolution de l'ADN non-B, l'évolution de l'ADN mitochondrial, la variation régionale des taux de mutation et l'obésité infantile. Les recherches menées dans le laboratoire du Dr Makova sont hautement interdisciplinaires et collaboratives. Le groupe collabore avec des statisticiens, des informaticiens et des biochimistes.

Environ 13% Le génome humain à certains motifs de séquence peut supposer des conformations différentes de la forme conventionnelle d'ADN-B décrite par Watson et Crick. Les exemples d'ADN non B comprennent les quadruplexes G, l'ADN triplex, l'ADN cruciforme et l'ADN Z. Ces structures remplissent des fonctions importantes dans la cellule, y compris la facilitation du tir des origines de réplication, l'initiation et la répression de la transcription, et la protection des télomères. Cependant, l'ADN non-B peut entraver la progression des polymérases pendant la réplication et peut entraîner une instabilité du génome et des taux de mutation élevés.

Dans ce projet, en utilisant des techniques statistiques innovantes du domaine de l'analyse des données fonctionnelles, nous modéliserons les contributions de l'ADN non-B à la variation régionale des taux de mutation. De plus, nous examinerons si l'ADN non-B a joué un rôle significatif dans les réarrangements du génome au cours de l'évolution des mammifères. Ensuite, nous concevrons de nouveaux tests de sélection statistique, qui tiendront compte des exigences structurelles de l'ADN non-B et identifieront des motifs d'ADN non-B supposément fonctionnels.